Caracterización molecular de brucella spp en ganaderías bovinas en el cantón Guaranda
Date
2024-12-05
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Universidad Estatal de Bolívar, Facultad de Ciencias Agropecuarias, Recursos Naturales y del Ambiente, Carrera de Medicina Veterinaria
Abstract
El presente trabajo de investigación se enfoca en la caracterización molecular de Brucella en las ganaderías del cantón Guaranda. La brucelosis es una enfermedad zoonótica que afecta a los animales y es causada por bacterias gramnegativas del género Brucella, provocando principalmente abortos e infertilidad, lo que conlleva pérdidas económicas significativas. Existe una carencia de información sobre la prevalencia de esta enfermedad en el cantón y sobre la identificación de las diferentes especies y biovares de Brucella. Se realizó un muestreo basado en el cálculo muestral finito del número total de hembras bovinas en edad reproductiva del cantón, con un margen de error del 7.3%, seleccionando una muestra por cada 146 hembras bovinas. Se utilizó la prueba iELISA para el diagnóstico serológico en 180 muestras de suero bovino y se confirmó mediante PCR, estableciendo su prevalencia. El secuenciamiento del material genético fue esencial para determinar la identidad de la bacteria en el cantón Guaranda. Los resultados mostraron una prevalencia del 2.8% mediante iELISA y del 3.8% mediante PCR, con una incidencia de 2 nuevos casos en un mismo predio. La parroquia más afectada fue San Lorenzo, con el 1.6% de los casos, mientras que las parroquias Gabriel Ignacio Veintimilla, Guanujo, Salinas y Simiatug presentaron una prevalencia del 0.5% cada una. La PCR y la secuenciación se realizaron en Macrogen, Inc., Seúl, Corea del Sur. Las secuencias obtenidas se limpiaron utilizando Chromas versión 2.6 y se ensamblaron con BioEdit versión 7.2, ingresándose posteriormente en BLAST para identificar la bacteria. Con MEGA versión 11.13, se construyó un árbol filogenético de las relaciones entre las diferentes biovariedades de Brucella. Este es el primer estudio en el que se identifica la bacteria mediante secuenciación en el cantón Guaranda.
Description
This research focuses on the molecular characterization of Brucella in livestock in the Guaranda canton. Brucellosis is a zoonotic disease affecting animals, caused by gram-negative bacteria of the genus Brucella, primarily leading to abortions and infertility, which result in significant economic losses. There is a lack of information on the prevalence of this disease in the canton and the identification of different Brucella species and biovars. A sampling was conducted based on a finite sample calculation of the total number of female cattle of reproductive age in the canton, with a 7.3% margin of error, selecting one sample for every 146 female cattle. The iELISA test was used for serological diagnosis in 180 bovine serum samples, confirmed by PCR to establish its prevalence. Genetic sequencing was essential to determine the identity of the bacteria in the Guaranda canton. Results showed a prevalence of 2.8% by iELISA and 3.8% by PCR, with an incidence of 2 new cases on the same farm. The most affected parish was San Lorenzo, with 1.6% of the cases, while the parishes Gabriel Ignacio Veintimilla, Guanujo, Salinas, and Simiatug each had a prevalence of 0.5%. PCR and sequencing were performed at Macrogen, Inc., Seoul, South Korea. The obtained sequences were cleaned using Chromas version 2.6 and assembled with BioEdit version 7.2, and then entered into BLAST for bacterial identification. A phylogenetic tree of the relationships among different Brucella biovars was constructed using MEGA version 11.13. This is the first study identifying the bacteria through sequencing in the Guaranda canton.